海南医学院于1993年7月经国家教委批准建立。学校的办学历史可追溯到1948年创立的私立海南医学专科学校及建国后续办的海南大学医学部。1994年获准授予学士学位。1997年被国家教委确认为本科教学工作合格学校。2000年实现校本部的搬迁。2003年被国家教育部确定为联合培养硕士学位研究生单位。2004年起与北京大学联合招收硕士研究生。2006年被教育部评为本科教学工作水平良好高校。2006年开办留学生教育。

　　学校现占地面积661.7亩，分城西校区（主校区）和龙华校区（旧校区）。学校现有教职员工1871人，其中医教研专业技术人员1266人。专业技术人员中，正高85人，副高237余人。专任教师中博士54人，硕士276人，占专任教师的60.7%。学校设有临床学院、高等职业教育学院、国际教育学院、中医学院、基础医学部、外语部、体育部、人文社会科学部、信息技术部、药学系、预防医学系、护理学系、口腔医学系、检验医学系等14个二级教学单位；有教育系统省级重点学科2个、卫生系统省级重点学科4个、省级精品课程8门、省级重点课程3门、6个基础实验室、5个专业实验室、87个教研室；图书馆藏书（含电子资源）近70万册；设有直属附属医院1家，床位编制1008张，非直属附属医院2家，病床总数近2000余张，临床教学（实习）医院22家，开放病床数6893张,另有教学基地10个。学校2008年普通招生设3个学科门类共17个本科专业，分别是临床医学、医学影像学、康复治疗学、预防医学、口腔医学、医学检验、护理学、药学、中医学、中西医临床医学、针灸推拿学、劳动与社会保障（医疗保险方向）、生物技术（医药方向）、市场营销（医药营销方向）、中药学、应用心理学（医学心理学方向）、公共事业管理（卫生事业管理方向），面向全国招生；具备招生资格的高职（专科）专业17个，包括临床医学、临床医学（社区医学方向）、医学检验技术、中医学、护理、医疗美容技术、口腔医学、药学、针灸推拿、助产、医学影像技术、眼视光技术、医学营养、卫生检验与检疫技术、医药营销、劳动与社会保障（医疗保险方向）、家政服务（医药卫生方向）；开设自学考试“专接本”护理学、药学及营养、食品与健康等3个专业。学校现有各类在校生10000余人，留学生100余人。2008年起高职（专科）学生由高等职业教育学院管理。